RGD环肽：环七肽c(GRGDSPA)

三字母：cyclo(Gly-Arg-Gly-Asp-Ser-Pro-Ala)(main chain cyclo)

Cyclo(GRGDSPA) 是一种靶向 αvβ3 整合素 (αvβ3 integrin) 的环状 RGD 肽。Cyclo(GRGDSPA) 可减少小鼠体内 B16-FE7 黑色素瘤克隆的形成。Cyclo(GRGDSPA) 可用于黑色素瘤研究。

通过构象分析结合密度泛函理论（DFT）计算，研究人员研究了具有显著抗转移活性的环状七肽理论上可能存在的稳定构象体。采用实验红外光谱与拉曼光谱技术，结合基于6-31G(d，p)基组的DFT量子化学计算方法，对环状结构(Gly-Arg-Gly-Asp-Ser-Pro-Ala){cyclo(grgdspa)}的结构与光谱特征进行了系统解析。基于振动模式的势能分布（PED%）数据，研究人员完成了振动光谱的完整分析。最终将计算结果应用于目标化合物的红外光谱与拉曼光谱模拟，模拟光谱与实验数据高度吻合。此外，通过理论计算开展了分子静电势与前线分子轨道分析。利用自然键轨道分析法评估了由超共轭相互作用与电荷离域效应导致的分子稳定性，高E²值表明供体与受体之间存在强相互作用。为阐明其抑制特性，研究人员对cyclo(grgdspa)与纤连蛋白进行了分子对接研究。

研究结果表明，对接配体{cyclo (grgdspa)}与人纤连蛋白形成稳定复合物，其结合亲和力值为−7.7 kcal/mol，这表明cyclo (grgdspa)可能对黑色素瘤细胞与人纤连蛋白的黏附具有抑制作用。

描 述：It has been demonstrated that the RGD-containing peptide, c(GRGDSPA), inhibited the binding of fibronectin to stimulated platelets with IC₅₀= 0.223 µM. c(GRGDSPA) also blocked thrombin-induced platelet aggregation with IC₅₀= 32 µM, but was less potent than native fibronectin in this respect.

参考文献：doi.org/10.1080/07391102.2017.1356240